- Die Wiederaufnahme und der Ausbau eines regelmäßigen und vertakteten Schienenpersonennahverkehrs zwischen Freiburg, Müllheim, Neuenburg und Mulhouse ist als „internationale Pilotstrecke“ ein wichtiges Element des Nahverkehrskonzeptes Breisgau-S-Bahn.
- Im Oktober 2002 beauftragten der ZRF und die Région Alsace ein deutsch-französisches Konsortium mit der Durchführung einer - von der EU im Rahmen des INTEREG-III-A Programms geförderten - Machbarkeitsstudie zur Wiederaufnahme des grenzüberschreitenden Schienenpersonenverkehrs zwischen Freiburg, Müllheim und Mulhouse.
- Mit Abschluss der Machbarkeitsstudie im Juli 2004 konnte nachgewiesen werden, dass ein regelmäßiges und vertaktetes Personenverkehrsangebot zwischen Freiburg, Müllheim und Mulhouse volkswirtschaftlich sinnvoll ist. Der ZRF, das Land Baden-Württemberg und die Région Alsace hatten sich daher seinerzeit für die stufenweise Reaktivierung der Bahnstrecke ausgesprochen.
- Als erste Stufe zur Realisierung dieses Ziels fand seit 2006 zwischen Müllheim und Mulhouse an Sonntagen im Sommer und in der Adventszeit wieder Personenverkehr statt, der sogenannte „Eventverkehr“. Finanziert wurde dieses Angebot vom Land Baden-Württemberg und der Région Alsace. Zum Einsatz kamen Dieseltriebwagen der SNCF, in Müllheim bestanden Anschlüsse nach bzw. aus Richtung Freiburg. In Mulhouse bestehen zahlreiche Umsteigemöglichkeiten zum französischen Regional- und Fernverkehr.
- Als zweite Stufe auf dem Weg zur planmäßigen Wiedereröffnung der gesamten Strecke wurden im Dezember 2009 Regionalzüge aus Richtung Freiburg, die vorher in Müllheim endeten, bis Neuenburg verlängert.
- Im Jahr 2010 wurde in einem gemeinsamen Projekt von Région Alsace, dem Land Baden-Württemberg, dem ZRF, Réseau Ferre de France (RFF), DB Netz AG und SNCF sowie mit großzügiger finanzieller Unterstützung der Europäischen Union im Rahmen des Programms INTERREG IV A Oberrhein die Signaltechnik zwischen Neuenburg und Bantzenheim ausgebaut und der sog. „automatische grenzüberschreitende Streckenblock“ mit Kosten von ca. 2,3 Mio. € fertiggestellt. Diese verbesserte technische Sicherung der Fahrt über die Grenze war Voraussetzung für die Wiederaufnahme des regelmäßigen Personenverkehrs.
- Ein regelmäßiger SPNV wurde als dritte Stufe (nach Eventverkehr und Regionalzügen bis Neuenburg) zur Reaktivierung der Strecke Müllheim – Mulhouse für einen regelmäßigen Nahverkehr in der deutsch-französischen „Absichtserklärung / Protocole d’intention“ vom 24.07.2008 mit täglich fünf Zugpaaren über die Grenze vereinbart.
- Für die Verbesserung des regelmäßigen grenzüberschreitenden Verkehrs zwischen Freiburg, Müllheim, Neuenburg und Mulhouse wurden in den vergangenen Jahren bereits umfassende Ausbaumaßnahmen auf beiden Seiten des Rheins umgesetzt.
- Auf französischer Seite ist der Ausbau der Strecke von der Grenze bis Mulhouse bereits in den Jahren 2011 und 2012 erfolgt und umfasste den Neubau eines elektronischen Stellwerks (ESTW) in Bantzenheim inkl. einer Fernsteuerung des Stellwerks in Ile-Napoleon, die Erneuerung der Signaltechnik, eine Gleiserneuerung und damit einhergehende Geschwindigkeitserhöhungen sowie den barrierefreien Ausbau des Bahnhofs Bantzenheim und dessen Ausbau zum Kreuzungsbahnhof. Diese Maßnahmen ermöglichten bereits eine Reduzierung der Fahrzeit um 10 min auf insgesamt 25 min Fahrzeit zwischen Müllheim und Mulhouse. Die Investitionen auf französischer Seite waren Teil des Contrat de plan Etat-Région 2007-2013.
- Seit Dezember 2012 verkehren zwischen Mulhouse und Müllheim wochentags täglich 7 Zugpaare (am Wochenende 5 Zugpaare), von denen zwei bis Freiburg durchgebunden werden.
- Auf deutscher Seite ist für das Jahr 2016 der Ausbau der Strecke zwischen Müllheim und Neuenburg geplant. Vorgesehen ist dabei der barrierefreie Ausbau des Bahnhofs Neuenburg, der Neubau eines ESTW mit Erneuerung der Signaltechnik und zweier Bahnübergänge, in einzelnen Teilbereichen eine Gleisbegradigung zur Erhöhung der Geschwindigkeit und damit einhergehend ein Umbau der Oberleitung. Der Planfeststellungsbeschluss für die genannten Maßnahmen wurde im Dezember 2014 durch das Eisenbahn-Bundesamt erlassen. Detaillierte Informationen zu dem Streckenausbau auf deutscher Seite sind auf der Homepage www.bsb2020.de vorhanden.
- Ziel ist ein durchgehender S-Bahnverkehr, der Freiburg bzw. Müllheim stündlich mit Mulhouse verbinden soll.
Weitere Informationen zu der grenzüberschreitenden Strecke können der Internetseite www.muellheim-mulhouse.eu entnommen werden.